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3. LigaFußball(M)
36. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | Karlsruher SC | Karlsruhe | 36 | 22 | 9 | 5 | 64:24 | 40 | 75 |
| 2 |  | Arminia Bielefeld | Bielefeld | 36 | 21 | 10 | 5 | 58:31 | 27 | 73 |
| 3 |  | VfL Osnabrück | Osnabrück | 36 | 21 | 7 | 8 | 60:34 | 26 | 70 |
| 4 |  | Preußen Münster | Pr. Münster | 36 | 19 | 12 | 5 | 59:29 | 30 | 69 |
| 5 |  | 1. FC Heidenheim 1846 | Heidenheim | 36 | 20 | 8 | 8 | 67:46 | 21 | 68 |
| 6 |  | Chemnitzer FC | Chemnitz | 36 | 14 | 9 | 13 | 50:46 | 4 | 51 |
| 7 |  | SV Wehen Wiesbaden | Wiesbaden | 36 | 11 | 18 | 7 | 49:46 | 3 | 51 |
| 8 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 36 | 13 | 9 | 14 | 45:50 | -5 | 48 |
| 9 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 36 | 12 | 9 | 15 | 40:45 | -5 | 45 |
| 10 |  | 1. FC Saarbrücken | Saarbrücken | 36 | 12 | 9 | 15 | 50:58 | -8 | 45 |
| 11 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 36 | 11 | 10 | 15 | 33:37 | -4 | 43 |
| 12 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 36 | 11 | 10 | 15 | 42:54 | -12 | 43 |
| 13 |  | Hansa Rostock | Rostock | 36 | 11 | 9 | 16 | 38:51 | -13 | 42 |
| 14 |  | Hallescher FC | Hallescher FC | 36 | 11 | 9 | 16 | 33:47 | -14 | 42 |
| 15 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 36 | 10 | 10 | 16 | 40:44 | -4 | 38 |
| 16 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 36 | 10 | 8 | 18 | 37:46 | -9 | 38 |
| 17 |  | SV Babelsberg 03 | Babelsberg | 36 | 9 | 10 | 17 | 31:46 | -15 | 37 |
| 18 |  | Borussia Dortmund II | Dortmund II | 36 | 8 | 13 | 15 | 36:56 | -20 | 37 |
| 19 |  | SV Darmstadt 98 | Darmstadt | 36 | 7 | 13 | 16 | 27:43 | -16 | 34 |
| 20 |  | Alemannia Aachen | Aachen | 36 | 6 | 10 | 20 | 36:62 | -26 | 23 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Abstieg
- Kickers Offenbach wurde vom DFB die Lizenz für die Drittligasaison 2013/2014 verweigert. Dem SV Darmstadt 98 blieb infolgedessen der Abstieg in die Regionalliga erspart.
- Nach Beendigung der Saison werden Alemannia Aachen und Kickers Offenbach aufgrund von Verstößen im Rahmen des wirtschaftlichen Zulassungsverfahrens jeweils 2 Punkte abgezogen.
- Alemannia Aachen wurde zudem aufgrund der nicht fristgerechten Rückzahlung von 200.000 Euro aus dem DFB-Kautionsfond mit einem Abzug von weiteren drei Punkten bestraft.
