3. LigaFußball(M)
36. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | 1. FC Union Berlin | Union Berlin | 36 | 22 | 11 | 3 | 56:19 | 37 | 77 |
| 2 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 36 | 19 | 7 | 10 | 52:41 | 11 | 64 |
| 3 |  | Fortuna Düsseldorf | Düsseldorf | 36 | 18 | 9 | 9 | 51:32 | 19 | 63 |
| 4 |  | SC Paderborn 07 | Paderborn | 36 | 18 | 8 | 10 | 59:38 | 21 | 62 |
| 5 |  | Bayern München II | Bayern II | 36 | 14 | 15 | 7 | 51:35 | 16 | 57 |
| 6 |  | Kickers Emden | Emden | 36 | 15 | 10 | 11 | 42:42 | 0 | 55 |
| 7 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 36 | 12 | 14 | 10 | 39:34 | 5 | 50 |
| 8 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 36 | 13 | 9 | 14 | 58:46 | 12 | 48 |
| 9 |  | SV Sandhausen | Sandhausen | 36 | 12 | 12 | 12 | 53:47 | 6 | 48 |
| 10 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 36 | 13 | 9 | 14 | 43:45 | -2 | 48 |
| 11 |  | Erzgebirge Aue | Aue | 36 | 12 | 11 | 13 | 42:41 | 1 | 47 |
| 12 |  | Dynamo Dresden | Dresden | 36 | 12 | 10 | 14 | 42:44 | -2 | 46 |
| 13 |  | Eintracht Braunschweig | Braunschweig | 36 | 12 | 8 | 16 | 43:46 | -3 | 44 |
| 14 |  | Jahn Regensburg | Regensburg | 36 | 10 | 12 | 14 | 34:48 | -14 | 42 |
| 15 |  | Wuppertaler SV | Wuppertal | 36 | 10 | 11 | 15 | 33:43 | -10 | 41 |
| 16 |  | VfR Aalen | VfR Aalen | 36 | 8 | 15 | 13 | 36:56 | -20 | 39 |
| 17 |  | Werder Bremen II | Werder II | 36 | 9 | 10 | 17 | 47:57 | -10 | 37 |
| 18 |  | FC Carl Zeiss Jena | Jena | 36 | 9 | 10 | 17 | 35:54 | -19 | 37 |
| 19 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 36 | 9 | 10 | 17 | 38:58 | -20 | 37 |
| 20 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 36 | 7 | 11 | 18 | 38:66 | -28 | 32 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen.
- Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten.
