3. LigaFußball(M)
18. Spieltag
| # | Mannschaft | Mannschaft | Sp. | S | U | N | Tore | Diff. | Pkt. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |  | SC Paderborn 07 | Paderborn | 18 | 12 | 2 | 4 | 36:21 | 15 | 38 |
| 2 |  | 1. FC Union Berlin | Union Berlin | 18 | 10 | 6 | 2 | 31:15 | 16 | 36 |
| 3 |  | Kickers Emden | Emden | 18 | 10 | 5 | 3 | 24:15 | 9 | 35 |
| 4 |  | Fortuna Düsseldorf | Düsseldorf | 18 | 10 | 3 | 5 | 28:14 | 14 | 33 |
| 5 |  | Bayern München II | Bayern II | 18 | 6 | 11 | 1 | 24:18 | 6 | 29 |
| 6 |  | SpVgg Unterhaching | Unterhaching | 18 | 8 | 5 | 5 | 23:24 | -1 | 29 |
| 7 |  | Rot-Weiß Erfurt | RW Erfurt | 18 | 8 | 3 | 7 | 25:20 | 5 | 27 |
| 8 |  | Kickers Offenbach | Offenbach | 18 | 6 | 8 | 4 | 23:18 | 5 | 26 |
| 9 |  | VfB Stuttgart II | VfB II | 18 | 6 | 6 | 6 | 32:24 | 8 | 24 |
| 10 |  | SV Sandhausen | Sandhausen | 18 | 6 | 6 | 6 | 29:26 | 3 | 24 |
| 11 |  | Eintracht Braunschweig | Braunschweig | 18 | 6 | 5 | 7 | 23:20 | 3 | 23 |
| 12 |  | Erzgebirge Aue | Aue | 18 | 6 | 5 | 7 | 23:25 | -2 | 23 |
| 13 |  | VfR Aalen | VfR Aalen | 18 | 4 | 10 | 4 | 15:21 | -6 | 22 |
| 14 |  | FC Carl Zeiss Jena | Jena | 18 | 5 | 6 | 7 | 22:28 | -6 | 21 |
| 15 |  | Wacker Burghausen | Burghausen | 18 | 5 | 4 | 9 | 24:35 | -11 | 19 |
| 16 |  | Wuppertaler SV | Wuppertal | 18 | 4 | 6 | 8 | 18:26 | -8 | 18 |
| 17 |  | Dynamo Dresden | Dresden | 18 | 4 | 5 | 9 | 13:21 | -8 | 17 |
| 18 |  | Jahn Regensburg | Regensburg | 18 | 3 | 7 | 8 | 16:30 | -14 | 16 |
| 19 |  | Stuttgarter Kickers | Kickers | 18 | 2 | 7 | 9 | 24:40 | -16 | 13 |
| 20 |  | Werder Bremen II | Werder II | 18 | 2 | 4 | 12 | 23:35 | -12 | 10 |
- Aufstieg
- Relegation
- Abstieg
- Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen.
- Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten.
